一般嵌入式所用的 CPU 多为 arm 架构的 CPU 。这个架构是特殊设计的，与 X86 不兼容。所以两个系统的二进制程序不同用。对于 Linux 来说，他们的源代码大部分是通用的（除了那些针对某种 CPU 或者设备进行特殊算法优化的，或者没有避让某些架构对于源代码编写的特殊要求的）。
正由于他们架构的区别，指令集的差异，所以他们的软件运行环境不同，编译环境也不同，有些软件做了兼容性处理，可以直接在两个不同架构下编译。
首先当然时系统的架构和cpu不一样了，嵌入式一般arm类的，电脑的是x86，mac之类的。这些硬件上的差异，所以在上面运行的linux系统也是不一样的：首先，启动方式不一样。其次linux内核也是根据各自的架构来编译成的。再有就是linux下的根文件系统，里面运行的模块，和一些环境库也都是不同的。
基本上嵌入式与桌面编程方式相同，目的不同。 （cpu， compiler 不同， booting script 也不同）嵌入式系统（Embedded system），是一种「完全嵌入受控器件内部，为特定应用而设计的专用电脑系统」嵌入式系统为控制、监视或辅助设备、机器或用於工厂运作的装置。
Linux操作系统软件包不仅包括完整的Linux操作系统，而且还包括了文本编辑器、高级语言编译器等应用软件。它还包括带有多个窗口管理器的X-Windows图形用户界面，如同我们使用Windows NT一样，允许我们使用窗口、图标和菜单对系统进行操作。
嵌入式系统和Windows系统的区别如下：含义的不同：嵌入式系统是一种“完全嵌入受控器件内部，为特定应用而设计的专用计算机系统”，根据英国电气工程师协会的定义，嵌入式系统为控制、监视或辅助设备、机器或用于工厂运作的设备。
Windows系统是通用操作系统，功能包括管理计算机系统的硬件、软件及数据资源；控制程序运行；改善人机界面；为其它应用软件提供支持等，使计算机系统所有资源最大限度地发挥作用，为用户提供方便的、有效的、友善的服务界面。
嵌入式操作系统（Threadx，Linux，VxWorks等等），一般都是小型化的 内核 ，体积比Windows小很多，并且可根据应用需求灵活裁剪。嵌入式应用程序，基于嵌入式处理器（ARM，PowerPC等）架构编译出来的，不能在Windows端运行。
包含的范围不同：Windows系统仅仅包含Windows操作系统本身，只是一个操作系统。而嵌入式系统包含底层嵌入式硬件、嵌入式操作系统（如Threadx，Linux，VxWorks等小型内核的轻量系统）和嵌入式应用程序三部分。嵌入式开发：Linux和Windows的区别嵌入式开发：Linux和Windows的区别Linux通常被认为比MicrosoftWindows更安全。
网络通讯不同 嵌入版：嵌入版没有网络通讯功能，不支持串口通讯、Modem串口通讯、以太网TCP/IP通讯，不能实现远程数据传输。通用版：通用版没有网络通讯功能，不支持串口通讯、Modem串口通讯、以太网TCP/IP通讯，不能实现远程数据传输。
嵌入式开发中，Linux和Windows是两个常见的操作系统，它们在很多方面都有显著的区别。以下是Linux和Windows在嵌入式开发中的主要区别：**开源vs闭源**：Linux是开源的操作系统，用户可以自由查看、修改和分发源代码。相比之下，Windows是闭源的，其源代码不对公众开放。
1、其实嵌入式系统就是微操作系统和功能软件的集成，在以微处理器为核心的微型计算机硬件体系中所形成的简易便捷，稳定可靠，经济实用的机电一体化产品。
2、嵌入式系统（Embedded system），是一种“完全嵌入受控器件内部，为特定应用而设计的专用计算机系统”。嵌入式处理器是嵌入式系统的核心，是控制、辅助系统运行的硬件单元。
3、嵌入式系统通常是面向特定应用的嵌入式CPU与通用型的最大不同就是嵌入式CPU大多工作在为特定用户群设计的系统中，它通常都具有低功耗、体积小、集成度高等特点，能够把通用CPU中许多由板卡完成的任务集成在芯片内部，从而有利于嵌入式系统设计趋于小型化，移动能力大大增强，跟网络的耦合也越来越紧密。
4、嵌入式系统主要由嵌入式处理器、相关支撑硬件、嵌入式操作系统及应用软件系统等组成，它是可独立工作的“器件”。
1、嵌入式系统的种类有：实时嵌入式系统、消费电子类嵌入式系统、智能监控嵌入式系统、医疗电子类嵌入式系统等。实时嵌入式系统专注于解决系统对实时性的高度需求问题，广泛应用于工业控制、航空航天等领域。消费电子类嵌入式系统则广泛应用于智能家居、智能穿戴等消费电子领域。
2、嵌入式操作系统的种类有很多，主要包括以下几种： Linux Linux是一种开源的嵌入式操作系统，广泛应用于各种嵌入式设备中。它具有强大的稳定性和良好的可移植性，能够支持多种硬件平台。此外，Linux具有丰富的软件资源和强大的网络功能，可以满足各种复杂的嵌入式应用需求。
3、嵌入式系统的类型包括：工业控制设备、智能家居设备、智能医疗设备以及智能车载设备等。嵌入式系统是一种专用计算机系统，它被嵌入到更大的设备或系统中作为其部分。以下是几种常见的嵌入式系统类型：工业控制设备是嵌入式系统的一种常见应用。